Desde la creación del CISAN hace más de tres décadas, el enfoque de sus investigaciones ha pasado por diversas etapas que se explican por la necesidad de abordar problemas actuales y complejos que conlleven a explorar nuevas fronteras del conocimiento. Así, ha respondido a una creciente demanda de nuevos conocimientos derivados de las transformaciones en los ámbitos económico, político, social y cultural de la región de América del Norte y el mundo, incluyendo las repercusiones y el papel de México en dicho contexto, redefiniendo prioridades de investigación, docencia y difusión que aporten al mejor entendimiento de la dinámica actual de Norteamérica.
El CISAN fortalece su potencial de investigación al dar cabida al análisis de temas imprescindibles para el estudio de Norteamérica en el área de las Ciencias Sociales y las Humanidades. Con el propósito de articular su trabajo académico en un ambiente más dinámico en el cual la libertad de investigación y docencia sean los pilares de la creatividad intelectual, el CISAN organiza sus proyectos clasificándolos en siete grandes líneas de investigación:
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1. Seguridad y gobernabilidad
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2. Procesos económicos, integración y desarrollo
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3. Migración y fronteras
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4. Identidades y procesos culturales
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5. Actores, estructuras y procesos sociales
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6. Ideas e Instituciones políticas
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7. Espacios, actores y comunidades digitales